分析液相色谱仪的目的是给一种组份进行定量和定性。制备液相色谱仪的目的是对产品的单体进行提取和纯化。与传统的纯化方法（如蒸馏、萃取）比较，制备液相色谱仪是一种更有效的分离方法，因此被广泛应用在样品和产品的提取和纯化上。随着合成、植化、生化和制药等领域对高纯度组份的需求不断增加，制备型液相色谱仪应用的领域也在迅速的扩大发展。

关于制备液相色谱仪的应用分类：1.天然药物化学、中药化学。这是国内目前广泛的使用方法，为了弄清楚植物中的微量有效成分，开放手工色谱柱早已不够用了，几乎每个搞天然药化的实验室都至少有一台液相，土豪实验室人手一台液相。

2.蛋白纯化。相对于前者，蛋白纯化的起步要稍微晚一点，但是发展很迅速。同时，由于外国仪器厂家在这个领域的优势不算太大，目前国内也在这个领域加快发展，抢占地盘。

3.药物杂质纯化。由于合成工艺并不能做到100%的产率，往往伴有副产品，如何获得微量的杂质并确定结构和含量，这就得靠液相色谱。

4.手性化合物的制备。这个主要是有机合成和方法学的在用。总之，目前有机化学领域里，开放手工柱层析依然是常用的分离手段，也是每个有机狗必会的技能之一，其在未来很长一段时间里将仍然扮演重要的角色。制备液相色谱仪已经在天然药化领域大面积使用，在将来，随着科研的需要和价格的下降，将会逐渐进入千家万户，终跟旋蒸一样普及。

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