在挑战性的应用中表现突出，包括低水平 PTM 分析、使用同量异序标签进行多通路相对定量测定、完整蛋白表征以及使用新型 Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos Tribrid 质谱仪对小分子进行 MSn 分析。该系统结合了极明亮的离子源、选择性和离子传输均得到改进的分段式四极杆滤质器、用于改进向 Thermo Scientific Orbitrap 质量分析仪进行离子传输的真空技术，以及 ETD 片段化覆盖范围更宽的 ETD HD。较新创新包括用于改进数据依赖实验的高级峰值测定 (APD) 算法和两个新硬件选项：UVPD 是采用 213 nm UV 光和 1 M 分辨率实现的全新裂解技术，它提供了 1,000,000 FWHM 的超高分辨率，用于改进同量异序化合物的结构解析和定量。