Bio-Rad推出染色质分析试剂盒
- 2011-03-10 13:19:551180
表观遗传学的研究越来越红火,Bio-Rad公司也顺应潮流,推出了EpiQ染色质分析试剂盒(EpiQ chromation analysis kit)。它是一个定量PCR分析,能对染色质结构进行快速的定量评估。再结合现有的表观遗传学分析,EpiQ试剂盒能协助科学家确定表观遗传学事件对基因表达调控的影响。
表观遗传学过程如DNA甲基化和组蛋白修饰通过改变染色质结构来控制基因表达。转录活跃的基因与“可接近”的染色质区域(常染色质)相关联,而转录沉默的基因常常位于“不可接近”的染色质区域(异染色质)。EpiQ试剂盒能够提供关于染色质是否可接近的定量信息,而这与基因表达有着非常强的相关性。然而,目前定量确定染色质结构状态的方法较为复杂,且耗时长。它需要从细胞中分离出细胞核,并进行染色质消化,通常需要两天以上才能完成。有了EpiQ试剂盒,无需分离细胞核,6小时即可获得染色质结构的数据。此外,该试剂盒只需要较少量的细胞(低至50,000个)就能开展分析EpiQ分析的流程包括:原位染色质消化、基因组DNA纯化,以及实时定量PCR,以便快速评估基因组特定区域的染色质环境。
基于EpiQ试剂盒中核酸酶消化的灵敏度,基因的染色质状态可原位确定。异染色质中的基因组DNA无法进行核酸酶消化,故可用于下游qPCR。EpiQ试剂盒对异染色质的分析显示出消化和未消化样品之间存在极少的定量循环数(Cq)改变。相反,常染色质中的DNA对核酸酶消化敏感,故不能用于qPCR。常染色质的分析显示出消化和未消化样品间存在较大的Cq改变。意大利Insubria大学结构与功能生物学系的教授Ian Marc Bonapace认为,EpiQ试剂盒是了解基因是否表达的捷径。Bonapace教授的研究对象是一个名为UHRF1的蛋白,它在DNA复制中确保了甲基化模式的准确遗传。Bonapace教授谈到:“如果我在研究一开始就拥有此试剂盒,那我就不会再进行昂贵且耗时的ChIP和qPCR实验了。”EpiQ试剂盒包含了细胞通透化和原位染色质消化的缓冲液、经过优化的核酸酶、纯化基因组DNA的材料、对照分析,以及EpiQ™ Chromatin SYBR® Green Supermix(扩增基因组DNA的实时定量PCR试剂)。此预混液可用于所有Bio-Rad实时定量PCR仪器以及其他厂家的仪器,不过有些仪器可能需要对预混液进行轻微调整。